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全式金助力天津科技大学研究登上PNAS杂志

发布时间:2021-08-30 14:22:25 点击次数:

 纤毛(也称为鞭毛)是突出于真核细胞表面的一类细胞器,由纤毛膜、轴丝和基底部的基体组成,负责感受外界刺激(如光、声、味、机械力和各类化学分子等)并将这些胞外信号传导到胞内,细胞对这些信息进行应答。研究表明定位于细胞膜的许多重要的信号分子包括G蛋白偶联受体、离子通道以及其他类型的信号蛋白均特异性定位于纤毛膜,这是决定纤毛进行信息传递的分子基础。目前已知,纤毛信号分子通过与分子动力蛋白(motor proteins)驱动的鞭毛内运输体(intraflagellar transport(IFT)train)进行偶联,从而使其得以沿着纤毛微管轴突在细胞膜和纤毛膜之间动态运动。纤毛信号分子在纤毛膜和细胞膜之间循环运输过程中,由八种保守蛋白(BBS1/2/4/5/7/8/9/18)组成的蛋白复合物BBSome在纤毛信号分子和鞭毛内运输体之间充当连接体(adaptor),其功能就是把纤毛信号分子偶联到鞭毛内运输体从而使其得以依赖于IFT在纤毛膜和细胞膜间进行动态运送。因此,能够导致BBSome组分缺失、组装缺陷或纤毛定位异常的基因突变,均可引发纤毛信号分子在纤毛膜内异常缺失或积累,从而导致巴德-毕德氏综合症(Bardet-Biedl syndrome,BBS)。亮氨酸拉链转录因子1 (LZTFL1) 可通过控制BBSome的含量来介导纤毛信号,是迄今为止发现的第17个与BBS有关的基因,LZTFL1基因突变会引发恶性肿瘤,继而发展为癌症。然而,迄今为止,这一过程背后的机制仍不明确。

 2021年8月26日,PNAS在线发表了天津科技大学樊振川团队完成的题为Chlamydomonas LZTFL1 mediates phototaxis via controlling BBSome recruitment to the basal body and its reassembly at the ciliary tip的研究论文。全式金生物参与了该项研究,完成了RNA-seq等相关实验环节,在该项研究中发挥了重要作用。该研究以莱茵衣藻为模式生物,利用遗传、生化、细胞和单分子体内活体成像及RNA测序分析等技术,阐明了LZTFL1通过调控BBSome向基底和纤毛尖端的重组来维持BBSome的纤毛动力学。


全式金助力天津科技大学研究登上PNAS杂志


 这项研究的主要发现归纳为:1) 低浓度的LZTFL1在纤毛基底聚集;2)LZTFL1在纤毛中扩散,并在纤毛尖端与IFT分离的BBSome结合;3)LZTFL1促进BBSome进入纤毛;4)LZTFL1通过BBS3BBSome送到基体;5)LZTFL1是稳定IFT25/27所必需的;6)IFT25/27促进了在纤毛尖端的BBSome重新组装;7)LZTFL1是一种趋光性的正调节因子,当纤毛中BBSome的异常积累或丢失,会破坏了纤毛BBSome的动力学,从而阻止了莱茵衣藻的趋光性。其中,在证明LZTFL1能稳定IFT25/27的实验中,发现天然LZTFL1和LZTFL1::YFP均存在于细胞质中,这与LZTFL1从细胞质转移到细胞核来抑制IFT25/27的转录的假设相反。因此,全式金生物利用RNA-seq分析,比较CC-125LZTFL1miRNA细胞中mRNAs的表达,发现在LZTFL1miRNA细胞中,有234个基因表达出现上调,422个基因表达出现下调(图A),22个IFT蛋白mRNA保持在WT水平(图B)。接着通过qPCR分析了LZTFL1miRNA细胞中IFT25、IFT27、IFT22、IFT46、IFT70、IFT38、IFT57、IFT43IFT139mRNA水平,发现它们均处于WT水平,表明除了IFT25/27外,LZTFL1不影响其他IFT的mRNA含量。


CC-125和LZTFL1miRNA细胞中转录水平差异分析

CC-125和LZTFL1miRNA细胞中转录水平差异分析


 全式金核酸纯化系列产品TransZol Up Plus RNA Kit(ER501)与二代测序系列产品 MagicPure? RNA Beads (EC501)TransNGS? RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina? (KP601)携手助力该项研究,这也是全式金首次以合作者的身份登上PNAS杂志。

 全式金迄今为止已获授权发明专利18篇,我们始终相信科技创新是企业发展的原动力。未来我们将继续秉持“品质高于一切,精品服务科研”的理念,为客户提供高品质产品,助力科研,与客户一起共同成长。


ER501: TransZol Up Plus RNA Kit

产品说明

 本试剂盒适用于从细胞和组织中提取总RNA,用TransZol Up裂解样品,加入氯仿后,溶液分为无色水相和粉红色有机相,RNA在水相中;用硅胶膜离心柱特异吸附水相中的RNA,与其它总RNA提取方法相比,既具有TransZol Up裂解能力强、提取量高,应用范围广的优点,又具有离心柱提取RNA纯度高的优点。

特点

 (1)应用范围广:动物、植物组织、病毒和细菌等样品。小量样品(50-100 mg组织、5×106 细胞、200 μl血液)。大量样品( ≥1 g 组织或≥107细胞),离心柱的最大吸附量为100 μg。

 (2)裂解能力强:裂解充分、速度快,提取量高。

 (3)提取速度快:一个小时内即可完成。

 (4)操作可视化:溶液呈粉红色,便于分离水相。

 (5)提取纯度高:DNA和蛋白质的污染低。


EC501: MagicPure? RNA Beads

特点

 操作简便,适用于自动化工作站。

与竞品的比较 

分别使用TransGen和Company V产品对不同输入量的人总RNA进行纯化,使用Qubit对纯化前后的RNA进行浓度测定,来确定RNA Beads的回收率。结果表明,不同RNA Beads的回收率无明显差异


与竞品纯化回收率比较

与竞品纯化回收率比较


KP601: TransNGS? II Stranded RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina?

特点

 (1)高文库转化率。

 (2)高数据质量。

适用范围

 (1)全转录组测序。

 (2)基因表达分析。

 (3)单核苷酸变异分析。

 (4)可变剪切检测。

 (5)融合基因检测。

 (6)非编码RNA和RNA前体分析。


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